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距离中国生物信息中心还有多远
2014-03-21 15:38:17
第三方平台
10月1日,包括医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站。由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧,联邦政府的非核心部门被迫关门。
NCBI 是由美国参议员Claude Pepper于上世纪80年代后期发起成立。旨在发展新的信息学技术来帮助理解那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程。此外,NCBI还负责开发自动化系统用于存储、分析关于分子生物学、生物化学、遗传学等方面知识信息;通过研究和医学团体所提供的软件和数据库使得其得以利用;收集国内外生物技术信息资源;开展基于计算机信息处理过程高级方法研究,用于分析生物大分子的结构和功能。
NCBI数据暂停更新,对于世界各地的研究者的影响不言而喻。世界各地的研究者不仅向NCBI提交自己的研究数据,同时还利用其旗下纷繁复杂而又功能强大的数据库帮助推进自己的研究。这对中国研究者的影响更甚,因为中国目前并没有自主的生物信息中心,NCBI数据暂停更新直接影响到中国研究者的工作。
随着高通量技术的发展,生命科学、生物医药的研究已经全面进入了大数据时代,生物信息已成为破译大数据必不可少的工具。中国没有自己的生物信息中心,一直面临着“出口转内销”的模式,科研数据不得不提交到国外数据库,需要数据时又不得不从国外数据库下载;网络技术的限制与瓶颈给科研人员带来了诸多烦恼。尽管中国是数据产出大国,每年向国外数据库递交了大量数据,但在他们眼中,中国一直是作为用户在使用他们免费提供的资源,而未做出任何贡献。这就导致中国在国际上彻底尚失了话语权并造成了负面影响。
庆幸的是,国内已有科研精英意识到建立生物信息数据库的重要性,并且开始正在筹划成立中国自主的生物信息学中心。该计划由陈润生等9位院士联名向院士局提议,现有12个国内优势的生命科学、生物医药、计算科学、生物信息等单位参与,其中包括北京大学生物信息学中心、中科院基因组学中心、北京蛋白质组学中心、太仓生物信息研究所等机构。项目正处于全面调研阶段,预计今年年底完成调研报告的撰写,争取纳入国家的“十三五”规划。
值得一提的是,在NCBI暂停更新之后,太仓生物信息研究所凭借自身技术优势为中国的生命科学研究发挥着积极的作用。
太仓生物信息研究所(TILSI)是一个学术研究机构、非盈利性的事业单位,致力于建设国内外生物数据、分析工具和科学文献资源的整合平台,为支持具有重大战略意义的国家级生命科学研究做出重要贡献,推动中国生命科学、生物医药以及生物信息学研究的发展。
目前TILSI已整合的6种数据类型——基因组、核酸、蛋白质、结构、疾病、分子间相互作用均为生命科学、生物医药研究领域常用的数据库,在NCBI暂停工作期间尚无需要更新的内容。6种类型的11个数据库中仅有Refseq参考序列数据库的数据来源于NCBI,其他数据主要来自EBI,EBI不会因为 NCBI暂停更新而停止更新,所以TILSI的数据资源不会受到影响,用户可放心使用。
另外TILSI自主研发了国内首个生命科学领域的全局搜索引擎bioso!,支持多种数据类型,方便科研工作者在海量的信息中整合出相关的数据。作为数据平台的入口,bioso!为用户提供了跨数据库的 “一站式”检索与“百科全书”式的展示。百科全书分为五个章节,已对外开放三个章节-基因与基因组,基因型与表现型,相互作用与网络;剩余两个章节处于准备阶段。
早日成立中国自主的生物信息学中心,从而整合国内现有的优质资源,开发出中国特色的数据库与服务,更好地为中国用户提供科研支撑,并且通过加入国际联盟,参与国际合作,才能提升中国在国际上的地位和话语权。
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元素百科为您介绍中科院研究人员破解二维泡沫演化百年难题。2月22日,记者从中国科学院化学研究所获悉,该所中国科学院化学研究所绿色印刷重点实验室研究员宋延林课题组科研人员对泡沫演变过程进行了有效调控,解决了困扰该领域科学家百余年来的科学难题。该研究成果发表在近期出版的《自然—通讯》杂志上。 泡沫的特殊性能泡沫具有高比表面积、可压缩性、声波控制、光学衍射和散射等特殊性能,并同时具有固体和液体的力学性质,是一个不稳定的体系。“大的更大、小的更小”是人们对泡沫的普遍印象。这类似于丛林法则的“弱肉强食”现象,被科学家们成为“奥斯瓦尔德熟化”机制。上百年来,这一机制成为人们研究并利用泡沫的难题。近年来,宋延林课题组在纳米材料印刷及图案化领域开展了系统研究。他们在固体表面打印和构造了精确可控的三维微米结构,突破传统印刷技术的精度极限,实现了微纳米尺度精细图案的印刷及纳米功能材料的可控组装,并发展了在印刷电子及可穿戴器件领域的应用。二维泡沫演变过程在此基础上,研究人员发现,这种带有微米结构的模板可以用于调控二维泡沫的演化。在泡沫中的气泡生长演变过程中,微米结构能调控气泡的表面曲率半径,使其不再随体积增大而增大,甚至还出现随体积增大而减小的情形。“这样,泡沫的演变由原来的‘弱肉强食’变成了‘限富济贫’的模式,正是‘反奥斯瓦尔德熟化’的模式。”研究人员表示。同时,他们还通过改变微结构的几何排列,调控泡沫演变成所设定的图案,从而实现二维泡沫演化的“可编程性”。据了解,图案化的二维气泡有望在透明电极等光电器件上应用。

化学词典告诉你pet塑料配方以及检测配方。pet塑料(聚对苯二甲酸乙二酯)广泛应用于薄膜、注塑、挤塑等塑料制品,而pet塑料配方主要有哪些?做塑料配方检测,目前国内比较流行且有效的分析技术手段是什么? pet塑料配方普通PET属于结晶性聚合物,PET薄膜经过拉伸取向后,会产生较大程度的结晶,如对其进行热封的话,会产生收缩变形,故普通的PET薄膜不具备热封性能。PET薄膜在用做商品包装时,为解决其热封口问题,通常采用将BOPET薄膜与PE薄膜或CPP薄膜进行复合的方法,从而在一定程度上限制了BOPET薄膜的应用为了解决热封问题,通过对PET树脂的改性,并且采用A/B/C三层结构的模头,现已开发出三层共挤的热封型PET薄膜,这种热封型PET薄膜的由于有一面是可热封层,故可直接进行热封合,使用十分方便。热封型PET薄膜可广泛应用于各种商品的包装和护卡膜等领域。提高PET薄膜的表面性能,以改善印刷的适应性和真空镀铝层的结合力,通常采用电晕处理的方法来提高薄膜的表面张力。但是,电晕法存在时效性等问题,特别是在高温、高湿的环境里,电晕处理后的薄膜张力很容易衰减。然而化学涂布法则不存在这样的问题,故受到印刷业和镀铝业的青睐。pet塑料配方检测分析塑料配方还原与成分检测过程中,需要用到很多分析仪器,如远/近红外光谱仪、核磁共振仪、电透镜、液相色谱仪、气质联用仪、也质联用仪等。每种仪器分析所得的图谱,也需要用到权威图谱解析数据库的数据资料,进行分析对比,进行印证。一般来说,热裂解光谱分析法以及气-质联用分析法相结合可以很好地解决塑料配方还原与成分检测中所遇到的技术问题。XPS中规定/不应有明显影响使用的可见缺陷,如塑料起泡、裂口、变形,是考虑到一旦有缺陷将影响塑料产品的吸水性、压缩强度、绝热性能等。

化学词典告诉你pet塑料的特点以及pet塑料等级分类。日常生活中我们随处可见各式各样的pet塑料制品,比如矿泉水瓶、碳酸饮料瓶等等。这些pet塑料的特点是什么呢?它们是如何分级的? pet塑料的特点1.热变形温度和长期使用温度是热塑性通用工程塑料中最高的;2.因为耐热高,增强PET在250℃的焊锡浴中浸渍10s,几乎不变形也不变色,特别适合制备锡焊的电子、电器零件;3.弯曲强度200MPa,弹性模量达4000MPa,耐蠕变及疲劳性也很好,表面硬度高,机械性能与热固性塑料相近;4.由于生产PET所用乙二醇比生产PBT所用丁二醇的价格几乎便宜一半,所以PET树脂和增强PET是工程塑料中价格是最低的,具有很高的性价比。5.PET树脂的粘接:sili-1706单组份室温硫化胶,固化后是弹性体具有优秀的防水,防震粘合剂,耐高低温,由于泀力科技根据树脂的分子结构研究,所以专门用于粘结工程塑料。 pet塑料等级 “01”———PET(聚对苯二甲酸乙二醇酯)矿泉水瓶、碳酸饮料瓶都是用这种材质做成的。饮料瓶不能循环使用装热水,这种材料耐热至70℃,只适合装暖饮或冻饮,装高温液体或加热则易变形,有对人体有害的物质溶出。并且,科学家发现,这种塑料制品用了10个月后,可能释放出致癌物,对人体具有毒性。因此,饮料瓶等用完了就丢掉,不要再用来作为水杯,或者用来做储物容器盛装其他物品,以免引发健康问题得不偿失。“02”———HDPE(高密度聚乙烯)承装清洁用品、沐浴产品的塑料容器、目前超市和商场中使用的塑料袋多是此种材质制成,可耐110℃高温,标明食品用的塑料袋可用来盛装食品。承装清洁用品、沐浴产品的塑料容器可在小心清洁后重复使用,但这些容器通常不好清洗,残留原有的清洁用品,变成细菌的温床,清洁不彻底,最好不要循环使用。“03”———PVC(聚氯乙烯)据介绍,这种材质的塑料制品易产生的有毒有害物质来自于两个方面,一是生产过程中没有被完全聚合的单分子氯乙烯,二是增塑剂中的有害物。这两种物质在遇到高温和油脂时容易析出,有毒物随食物进入人体后,容易致癌。目前,这种材料的容器已经比较少用于包装食品。如果在使用,千万不要让它受热。“04”———LDPE(低密度聚乙烯)保鲜膜、塑料膜等都是这种材质。耐热性不强,通常,合格的PE保鲜膜在温度超过110℃时会出现热熔现象,会留下一些人体无法分解的塑料制剂。并且,用保鲜膜包裹食物加热,食物中的油脂很容易将保鲜膜中的有害物质溶解出来。因此,食物入微波炉,先要取下包裹着的保鲜膜。“05”———PP(聚丙烯)微波炉餐盒采用这种材质制成,耐130℃高温,透明度差,这是唯一可以放进微波炉的塑料盒,在小心清洁后可重复使用。需要特别注意的是,一些微波炉餐盒,盒体以05号PP制造,但盒盖却以06号PS(聚苯乙烯))制造,PS透明度好,但不耐高温,所以不能与盒体一并放进微波炉。为保险起见,容器放入微波炉前,先把盖子取下。“06”———PS(聚苯乙烯)这是用于制造碗装泡面盒、发泡快餐盒的材质。又耐热又抗寒,但不能放进微波炉中,以免因温度过高而释出化学物。并且不能用于盛装强酸(如柳橙汁)、强碱性物质,因为会分解出对人体不好的聚苯乙烯。因此,您要尽量避免用快餐盒打包滚烫的食物。“07”———PC及其他类PC是被大量使用的一种材料,尤其多用于制造奶瓶、太空杯等,因为含有双酚A而备受争议。专家指出,理论上,只要在制作PC的过程中,双酚A百分百转化成塑料结构,便表示制品完全没有双酚A,更谈不上释出。只是,若有小量双酚A没有转化成PC的塑料结构,则可能会释出而进入食物或饮品中。因此,在使用此塑料容器时要格外注意。