病毒感染是癌症发生的主要危险因素，病毒参与癌变过程，并与癌症的许多特征有关。如果能够发现人类癌症中病毒的关联布局，将为减少癌症的全球影响提供了可行的机会。近日，发表在《自然—遗传学》期刊上的一项研究中，来自德国癌症研究中心的科学家们，在探索人类癌症中病毒的分布研究中取得最新进展。据了解，作为“全基因组全癌分析”（PCAWG）联盟的一部分，该中心收集了由国际癌症基因组联盟ICGC和癌症基因组图谱（TCGA）项目产生的38种肿瘤中2658种癌症的全基因组和一部分转录全基因组测序数据。这些测序数据通过标准化、高精度的管道重新分析，以与人类基因组（构建hs37d5）对齐，并识别生殖系变异和体细胞获得的变异。研究人员应用了三个独立开发的病原体检测管道“计算病原体序列识别”、“病原体发现管道”和“寻找病原体”来系统地研究潜在的病毒病原体，并在382个基因组和68个转录组数据集中都检测到了病毒存在。研究发现，已知的与肿瘤相关的病毒（如爱泼斯坦-巴尔病毒（EBV），乙型肝炎病毒（HBV）和人乳头瘤病毒（HPV；例如HPV16或HPV18））的检出率都很高。这项研究揭示了头颈癌中HPV和驱动基因突变的显着排他性以及HPV与APOBEC突变特征的相关性，这表明抗病毒防御能力下降是宫颈癌，膀胱癌和头颈癌的的诱因。对于HBV，HPV16，HPV18和腺相关病毒（AAV2），病毒整合与基因组拷贝数的局部变异有关。在TERT启动子处的整合与端粒酶的高表达有关，从而明显激活了该肿瘤驱动过程。高水平的内源性逆转录病毒（ERV1）表达与肾癌患者的较差的生存结果有关。参考文献：MarcZapatka,IvanBorozan,DanielS.Brewer,MuratIskar,AdamGrundhoff,MalikAlawi,NikitaDesai,HolgerSltmann,HolgerMoch,ColinS.Cooper,RolandEils,VincentFerretti,PeterLichter.Thelandscapeofviralassociationsinhumancancers.NatureGenetics.DOI:10.1038/s41588-019-0558-9

由于糖肽类抗生素的广泛应用，甚至滥用，耐药的金葡菌和肠球菌日益增多。解决持续的抗生素危机，发现能够治疗耐药性感染且具有新颖作用机制的化合物十分关键。最近《自然》杂志上的一篇研究报道，来自加拿大麦克马斯特大学的科学家们，发现了新的抗耐药感染抗生素。据了解，许多抗生素均来自细菌产生的专门代谢产物，特别是放线菌家族的代谢产物。但是，尽管传统上是基于活性平台筛选放线菌提取物的，但是这种方法已经不能帮助科研工作者发现更多更新的抗生素。 于是，研究人员利用生物合成基因的系统发育以及缺乏已知的抗性决定簇来预测可能具有新生物活性的抗生素糖肽家族的不同成员。通过预测发现了一种新的功能模式的糖肽抗生素新功能类中的两个成员，其中一个是已知的糖肽抗生素补全他汀，另一个是新的化合物，称为Corbomycin。研究人员表明，最新发现的化合物Corbomycin来自于土壤细菌汇总所产生的糖肽抗生素家族。它和已知的糖肽抗生素补全他汀都能通过阻断细胞壁功能来消灭细菌。另外，研究人员还发现，通过结合肽聚糖，补全他汀和Corbomycin阻断自溶素，能够抑制细菌分裂。自溶素是生长过程中细胞壁重塑所必需的肽聚糖水解酶。在感染的小鼠模型中，Corbomycin和Complestatin的抗药性水平较低，可有效减少细菌负担。参考文献： ElizabethJ.Culp,NicholasWaglechner,WenliangWang,AlineA.Fiebig-Comyn,Yen-PangHsu,KalinkaKoteva,DavidSychantha,BrianK.Coombes,MichaelS.VanNieuwenhze,YvesV.Brun,GerardD.Wright.Evolution-guideddiscoveryofantibioticsthatinhibitpeptidoglycanremodelling.Nature.DOI:10.1038/s41586-020-1990-9

生物安全柜是一种箱型空气净化负压安全装置，在操作具有感染性危害的实验时，能够保护操作人员、样品及环境的安全。生物安全柜已广泛应用于生物安全柜已广泛应用在医疗卫生、疾控中心、生物医药、环境监测以及各类科研实验室等领域。此次疫情中，面对传染性极强的新型冠状病毒，生物安全柜作为实验室一级防护屏障，在新冠病毒核酸检测中起到了重要作用。在核酸检测过程中，样本的包装、样本的取出、核酸的提取等工作都是在负压实验室中的生物安全柜里完成的。目前在用的主要为Ⅱ级安全柜 ，Ⅱ级生物安全柜有前窗操作口，操作者可以通过前窗操作口在安全柜内进行操作。前窗操作口的流入气流主要起到了对操作区的屏障作用，通过控制流入气流的流速，有效的保障操作区内的污染物不会逸出生物安全柜。所以在安全柜内取出新冠病毒样本，既是开盖后产生气溶胶，也不会溢出到实验室内，从而能够保护操作人员的安全。不仅如此，安全柜顶层有高效过滤器，外界空气经高效过滤后进入安全柜内，可以避免样品被污染，柜内的空气也经过过滤器的过滤后再排到大气中，以保护操作者和实验室环境。在检测结束后，要注意按照相关的生物安全要求对进行新冠病毒核酸检测操作的安全柜、台面及实验室环境及时进行有效的消毒。参考文献：1.苏建程.生物安全柜的设计原理及选择与安装生物安全柜的方法.[J]MedicalEquipment,May.2019,Vol.32,No.92.中华人民共和国国家卫生健康委员会官网.新型冠状病毒实验室生物安全指南（第二版）